Vývoj a verifikace nových detekčních metod patogenů je hlavním cílem projektu. V tomto ohledu byly řešeny následující cíle: (i) optimalizace stávajících laboratorních metod a postupů (PCR a qPCR), (ii) vývoj metody LAMP, umožňující detekci patogenů přímo v terénu, což přispěje k rychlejší, a tím i k efektivnější aplikaci ochranných opatření (připravujeme samostatnou aktualitu na toto téma) a (iii) vývoj metod využívajících tzv. environmentální DNA (eDNA), umožňující detekovat přítomnost patogenů z jejich prostředí (vzorky vody), namísto klasického odběru vzorků (stěry z pokožky obojživelníků). Blíže se problematice eDNA v souvislosti s detekcí chytridiomycet Bd a Bsal věnuje samostatná aktualita.
V terénních podmínkách jsme potvrdili použitelnost rychlé detekce patogenů pomocí metody LAMP. Díky identifikaci pozitivních jedinců bylo možné potvrdit přítomnost a míru infekce Bd přímo v terénu a tuto informaci využít k odběru vzorků ke kultivaci. Náš testovaný postup vedl k první úspěšné kultivaci místní linie Bd z České republiky. Kultura je momentálně testována na VETUNI a slouží k přípravě kontrolních testovacích vzorků a kvantifikačních standardů. Zároveň jsme otestovali metodu qPCR k identifikaci genetických linií Bd. Pokračovali jsme rovněž v testování a optimalizaci standardně používaných postupů (PCR a qPCR) pro detekci dalších patogenů obojživelníků (ranviry, herpesviry, Perkinsea, Oomycéty, Mesomycetozoa, Mycobacterium).